Il miracolo attribuito all’intercessione della Beata Elisabetta della Trinità è avvenuto nell'aprile dell'anno 2002 a Flavignerot (Digione), durante un pellegrinaggio che la Signora Marie-Paul Stevens fece, accompagnata da due cari amici, per dare un ultimo saluto all’amata Elisabetta e chiedere la grazia di morire da cristiana, dando testimonianza all’amore infinito di Dio. Infatti, la sindrome di Sjogren, che si era progressivamente manifestata a partire dal 1997, l’aveva portata prima all’invalidità completa e poi alle soglie della morte, nell’impossibilità di nutrirsi di cibi solidi, di deambulare senza aiuto e con vari altri disturbi. La guarigione dei sintomi fu sorprendentemente e inaspettatamente immediata, completa e duratura.
Il miracolo grazie al quale il Venerabile Maria-Eugenio del Bambino Gesù potrà essere beatificato, è avvenuto il 27 ottobre del 1986. Riguarda un bambino che, pochi giorni dopo la nascita, fu operato per la comparsa di un linfangioma cistico del collo e, dopo tre giorni, dovette esser rioperato d’urgenza a causa di un’improvvisa emorragia. Una fistola del dotto linfatico causava un’abbondante perdita linfatica, con conseguenti problematiche metaboliche, infettive e nutrizionali che ne stavano gravemente compromettendo la sopravvivenza. L’improvvisa e misteriosa scomparsa del tubo di drenaggio a livello della ferita segnò il rapido miglioramento delle condizioni del bambino che poté essere nutrito normalmente e dimesso dall'ospedale senza ulteriori complicazioni.